MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid CMR15_mp

Total Repeats: 6555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017589	T	6	6	4	9	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017589	CGG	2	6	38	43	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017589	TCCC	2	8	112	119	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_017589	AAC	2	6	133	138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017589	GCTT	2	8	201	208	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017589	TGA	2	6	226	231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017589	A	7	7	394	400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017589	GC	3	6	553	558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017589	AGGC	2	8	586	593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017589	GTA	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017589	GTAT	2	8	646	653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017589	CCGT	2	8	673	680	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017589	CCG	2	6	703	708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017589	ACG	2	6	720	725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017589	A	6	6	729	734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017589	AAAG	2	8	1899	1906	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017589	GCC	2	6	1913	1918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017589	GGGCA	2	10	2231	2240	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017589	CGGC	2	8	2252	2259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017589	TCA	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017589	CGA	2	6	2364	2369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017589	AAAAG	2	10	2697	2706	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017589	A	6	6	2980	2985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017589	CAACT	2	10	2986	2995	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017589	GAC	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017589	CAT	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017589	AGA	2	6	3123	3128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017589	TTC	2	6	3201	3206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017589	AAT	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017589	GCC	2	6	3326	3331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017589	GGA	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017589	TCT	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017589	T	8	8	5077	5084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017589	GGC	2	6	5152	5157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017589	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017589	TGTT	2	8	5274	5281	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017589	CGC	2	6	6224	6229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017589	A	6	6	6306	6311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017589	TAGG	2	8	6312	6319	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017589	ACG	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017589	CCG	2	6	6348	6353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017589	TGC	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017589	ACA	2	6	6415	6420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017589	CTA	2	6	7407	7412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017589	GGCC	2	8	7418	7425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017589	CG	3	6	7446	7451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017589	GCC	2	6	7488	7493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017589	CG	3	6	7544	7549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017589	CTT	2	6	7570	7575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017589	CCCA	2	8	7587	7594	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_017589	GCC	2	6	7646	7651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017589	GCG	2	6	13105	13110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017589	CGGG	2	8	13176	13183	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017589	G	6	6	13190	13195	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017589	AT	3	6	13214	13219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017589	CCG	2	6	13234	13239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017589	GGCA	2	8	13255	13262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017589	TCG	2	6	13269	13274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017589	GCG	2	6	13698	13703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017589	CGGC	3	12	13709	13720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017589	GCCG	2	8	13775	13782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017589	CG	3	6	16495	16500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017589	GCC	2	6	16544	16549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017589	GCGCC	2	10	16607	16616	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_017589	GACT	2	8	16692	16699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017589	GC	4	8	16700	16707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017589	CGCC	2	8	16803	16810	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_017589	G	6	6	16851	16856	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017589	CGGG	2	8	16858	16865	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017589	T	6	6	18189	18194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017589	CA	3	6	18207	18212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017589	TCA	2	6	18216	18221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017589	CCGGCG	2	12	21557	21568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017589	GAA	3	9	22495	22503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017589	TCG	2	6	22690	22695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017589	CGT	2	6	22761	22766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017589	TGCGC	2	10	22772	22781	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017589	GCC	2	6	22809	22814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017589	GCG	2	6	22817	22822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017589	GCG	2	6	22832	22837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017589	CGG	2	6	22851	22856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017589	GCG	2	6	22860	22865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017589	GC	3	6	22869	22874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017589	GC	3	6	22902	22907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017589	GTC	2	6	23310	23315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017589	GCC	2	6	23322	23327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017589	TGC	2	6	24759	24764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017589	GCG	2	6	24803	24808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017589	CCG	2	6	24844	24849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017589	GCT	2	6	24953	24958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017589	CGA	2	6	25012	25017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017589	CTG	2	6	25035	25040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017589	GCG	2	6	25052	25057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017589	GGA	2	6	25199	25204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017589	CCGCA	2	10	25225	25234	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_017589	G	6	6	25255	25260	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017589	CCGG	2	8	25266	25273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017589	GC	3	6	25327	25332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017589	ACG	2	6	25341	25346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017589	GAGGGC	2	12	25392	25403	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017589	GCA	2	6	25468	25473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017589	TTG	2	6	25542	25547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017589	GC	3	6	25807	25812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017589	CG	3	6	25940	25945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017589	ACGC	2	8	25948	25955	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017589	GGT	2	6	26096	26101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017589	GTT	2	6	26115	26120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017589	GCG	2	6	26131	26136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017589	C	7	7	26172	26178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_017589	CCG	2	6	26291	26296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017589	ATC	2	6	26302	26307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017589	CGG	2	6	26310	26315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017589	AGG	2	6	26351	26356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017589	CAAA	2	8	26357	26364	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017589	AAAT	2	8	26372	26379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017589	G	6	6	26385	26390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017589	CT	3	6	26403	26408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017589	GCT	2	6	26409	26414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017589	AGC	2	6	26417	26422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017589	GC	3	6	26444	26449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017589	GCCG	2	8	27248	27255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017589	TGA	2	6	27274	27279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017589	CG	3	6	27283	27288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017589	CCGG	2	8	27291	27298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017589	GC	3	6	27311	27316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017589	GAT	2	6	27351	27356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017589	CG	3	6	27380	27385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017589	CAC	2	6	27443	27448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017589	GCG	2	6	27449	27454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017589	TGC	2	6	27468	27473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017589	GGC	2	6	27983	27988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017589	GCG	2	6	28010	28015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017589	GCG	2	6	28022	28027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017589	GCGCC	2	10	28136	28145	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
135	NC_017589	GGCC	2	8	28173	28180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017589	A	7	7	28215	28221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017589	CG	4	8	28237	28244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017589	GTT	2	6	28293	28298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017589	GC	3	6	28342	28347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017589	CGC	2	6	28362	28367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017589	CAC	2	6	28370	28375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017589	ATTCGA	2	12	28442	28453	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_017589	AGG	2	6	28922	28927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017589	GCC	2	6	28990	28995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_017589	TTC	2	6	29000	29005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017589	CCG	2	6	29006	29011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_017589	GCC	2	6	29019	29024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_017589	TTC	2	6	29042	29047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017589	GGC	2	6	29115	29120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017589	TCCG	2	8	29151	29158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017589	GGT	2	6	29171	29176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017589	GCCG	2	8	29207	29214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017589	GCC	2	6	29216	29221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_017589	GC	3	6	29222	29227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_017589	GCC	2	6	29238	29243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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158	NC_017589	GGC	2	6	29303	29308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_017589	T	6	6	29358	29363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_017589	GGC	2	6	31044	31049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_017589	TTTCT	2	10	31147	31156	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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174	NC_017589	CCG	2	6	34022	34027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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183	NC_017589	CCG	2	6	34629	34634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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186	NC_017589	GGT	2	6	34920	34925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_017589	TCG	2	6	76453	76458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_017589	CGTT	2	8	77803	77810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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284	NC_017589	CGGT	2	8	77847	77854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
285	NC_017589	GGC	2	6	77882	77887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_017589	CAG	2	6	77913	77918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_017589	TGT	2	6	78603	78608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_017589	CGGG	2	8	78628	78635	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
290	NC_017589	TGC	2	6	78661	78666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_017589	GTTCC	2	10	78674	78683	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
292	NC_017589	GC	4	8	82803	82810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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294	NC_017589	GCC	2	6	82835	82840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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296	NC_017589	TGAT	2	8	82901	82908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_017589	AGC	2	6	118541	118546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_017589	GGT	2	6	118547	118552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_017589	T	6	6	118583	118588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_017589	GTT	2	6	118891	118896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_017589	ATG	2	6	118915	118920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_017589	CACGC	2	10	118931	118940	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
432	NC_017589	TCGCGC	2	12	118946	118957	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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434	NC_017589	CCG	2	6	119935	119940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_017589	GCC	2	6	119945	119950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
436	NC_017589	GCG	2	6	119964	119969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_017589	CCG	2	6	121293	121298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
438	NC_017589	TGCGC	2	10	122370	122379	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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441	NC_017589	CG	3	6	122480	122485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
442	NC_017589	CGGCG	2	10	122514	122523	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
443	NC_017589	GCG	2	6	123840	123845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_017589	GCC	2	6	124492	124497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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451	NC_017589	CCG	2	6	124551	124556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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456	NC_017589	AGC	3	9	125937	125945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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458	NC_017589	CAA	2	6	125972	125977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_017589	CAT	2	6	126018	126023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_017589	G	6	6	126101	126106	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017589	CGG	2	6	126190	126195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_017589	G	6	6	127568	127573	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_017589	ATT	2	6	132232	132237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_017589	CTT	2	6	132582	132587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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493	NC_017589	GGC	2	6	132792	132797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_017589	GCCG	2	8	133285	133292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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